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Western Blot 中如何選擇內(nèi)參抗體嗎?
點擊次數(shù):1067 更新時間:2018-09-12

Western Blot 即免疫印跡試驗,可以利用 Western Blot 來比較在不同條件下,不同細(xì)胞組織中目的蛋白表達(dá)量的差異,屬于定性,半定量試驗。既然有差異性比較,參照物*。Western Blot 試驗中的標(biāo)準(zhǔn)(表達(dá)量)參照物即內(nèi)參,有了參照物才能準(zhǔn)確地比較目的蛋白表達(dá)量的差異。內(nèi)參一般選用管家基因表達(dá)的蛋白,它們在各個組織細(xì)胞中表達(dá)相對恒定,不會因為外部條件變化而引起表達(dá)量的變化。而且內(nèi)參可以監(jiān)測整個試驗體系是否正常,比如蛋白提取過程,轉(zhuǎn)膜體系,顯色體系等。

beta Actin、beta Tubulin、GAPDH、Lamin B1、PCNA 等已作為成熟的內(nèi)參運用到試驗中,下面就大致介紹下如何選擇內(nèi)參:

樣本來源

● 如果是哺乳動物的組織或細(xì)胞,主要以 beta Actin、beta Tubulin、GAPDH、Lamin B1、PCNA 為代表;

● 如果是植物樣本,主要以 actin、Rubisco 為代表。

目的蛋白定位

● 全細(xì)胞蛋白和細(xì)胞質(zhì):beta Actin、beta Tubulin、GAPDH 等;

● 細(xì)胞核蛋白: PCNA 等;

● 核膜蛋白:Lamin B1 等;

● 胞膜蛋白:Na(+)/K(+) ATPase 等。


目的蛋白分子量

beta Actin、beta Tubulin、GAPDH 的分子量分別是 42kd,50kd,37kd,目的蛋白分子量能與內(nèi)參蛋白分子量相差 5kd 以上,才能分開目的蛋白和內(nèi)參,寫文章做圖也更美觀;

三大內(nèi)參

beta Actin,肌動蛋白,細(xì)胞骨架蛋白。它們在各組織和細(xì)胞中的表達(dá)相對恒定,在檢測蛋白的表達(dá)水平變化時常用它來做參照物。beta Actin 作為內(nèi)參是得到*的,針對大多數(shù)組織和細(xì)胞來說的,它廣泛分布于細(xì)胞質(zhì)內(nèi),表達(dá)量非常豐富。但是在一些少量特殊的情況下比如脂肪組織和細(xì)胞內(nèi),beta Actin 的表達(dá)量就很少。

GAPDH,甘油醛-3-磷酸脫氫酶,該酶是糖酵解反應(yīng)中的一個酶,幾乎在所有組織細(xì)胞中都高水平表達(dá),在同種細(xì)胞或組織中的表達(dá)量一般是恒定的,且很少受外部誘導(dǎo)物的影響。但比如缺氧和糖尿病等疾病存在下,會增加 GAPDH 在特定細(xì)胞和組織中的表達(dá)。

beta Tubulin,微管蛋白,細(xì)胞骨架蛋白。作為內(nèi)參抗體,beta Tubulin 表達(dá)通常不會發(fā)生改變,因此被廣泛用于 Western Blot 內(nèi)參,也常被用于免疫染色觀察細(xì)胞的微管結(jié)構(gòu)。

下面是在開發(fā)抗體時的一點心得,希望對大家有幫助。

1. 不同的內(nèi)參在選擇上也要根據(jù)具體的樣本情況選擇,沒有一種內(nèi)參能適用所有的組織和細(xì)胞樣本。比如,血紅細(xì)胞(因為其細(xì)胞結(jié)構(gòu)的特殊性和需要攜帶氧氣的功能性)樣本就不適合以上 3 種常用內(nèi)參。如果使用會導(dǎo)致結(jié)果很差或者沒有結(jié)果。可以選用血紅細(xì)胞的結(jié)構(gòu)性蛋白作為內(nèi)參代替。


2. 在做多組織多細(xì)胞樣本對比表達(dá)量時,選用 GAPDH 作為內(nèi)參,因為 GAPDH 是代謝類蛋白,在活組織中表達(dá)比較恒定。而 beta Actin 和 beta Tubulin 是結(jié)構(gòu)蛋白,不同組織的細(xì)胞結(jié)構(gòu)會有差異性,如腦組織的 tubulin 的表達(dá)會高一些(因為神經(jīng)細(xì)胞的軸突和樹突都由 tubulin 維持結(jié)構(gòu)),而 actin 的表達(dá)量可能會低一些。再比如,骨骼肌、心肌和平滑肌的特殊功能反而導(dǎo)致了 tubulin 的表達(dá)改變和特化。心肌的 beta Actin 的表達(dá)量可能變少,而 alpha Actin 表達(dá)量高。因為這些組織的差異,現(xiàn)在慢慢采用總 Actin 和總 tubulin 作為內(nèi)參,可以盡量減少一些組織表達(dá)量差異。

3. 做各種分泌液樣本的時候,如血漿,乳汁,組織液等,以上的 3 種內(nèi)參也不是很合適。由于沒有完整的細(xì)胞結(jié)構(gòu),所以只能選擇一些分泌蛋白作為內(nèi)參,或者采用其他方式作為內(nèi)參。

4. 做誘導(dǎo)后樣本或檢測磷酸化等修飾性抗體時,選擇結(jié)構(gòu)蛋白作為內(nèi)參,如 beta Actin 和 beta Tubulin。因為 GAPDH 是代謝類蛋白,表達(dá)量有可能會受到誘導(dǎo)處理的影響。同時,做修飾性抗體的 Western Blot 實驗,也帶上同抗原的總抗作為陽性對照。

5. 做 Western Blot 實驗時,內(nèi)參的條帶強度也要適當(dāng)控制。不要讓內(nèi)參條帶發(fā)生過度曝光的情況,尤其是用 X 膠片曝光的。如果內(nèi)參條帶過度曝光,條帶會顯得很寬,妨礙對條帶正確強度的判讀,進(jìn)而影響對其他實驗結(jié)果的判斷。的內(nèi)參結(jié)果是: 窄窄的,黑色實心條帶。
 

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