1.常規的PCR反應體系所需試劑
①高壓過的超純水(高壓的目的是使其中的 DNase失活,以免降解模板DNA);
②PCR緩沖液(選用與所用聚合酶對應的緩沖液) ;
③4種dNTP混合物(每種dNTP的濃度為2.5mmol/L);
④引物(引物合成后,用超純水稀釋為10mmol/L);
⑤熱穩定的DNA聚合酶(不同廠家、不同批次的酶可能會有差異);
⑥DNA模板(盡量使用純化后的核酸作為模板)。
2.實驗儀器
PCR熱循環儀、核酸電泳儀、凝膠成像設備、離心機等
PCR實驗操作注意事項
盡管擴增序列的殘留污染大部分是假陽性反應的原因,樣品間的交叉污染也是原因之一。因此,不僅要在進行擴增反應是謹慎認真,在樣品的收集、抽提和擴增的所有環節都應該注意:
(1)戴一次性手套,若不小心濺上反應液,立即更換手套。
(2)使用一次性吸頭,嚴禁與PCR產物分析室的吸頭混用,吸頭不要長時間暴露于空氣中,避免氣溶膠的污染。
(3)避免反應液飛濺,打開反應管時為避免此種情況,開蓋前稍離心收集液體于管底。若不小心濺到手套或桌面上,應立刻更換手套并用稀酸擦拭桌面。
(4)操作多份樣品時,制備反應混合液,先將dNTP、緩沖液、引物和酶混合好,然后分裝,這樣即可以減少操作,避免污染,又可以增加反應的精確度。
(5)最后加入反應模板,加入后蓋緊反應管。
(6)操作時設立陰陽性對照和空白對照,即可驗證PCR反應的可靠性,又可以協助判斷擴增系統的可信性。
(7)盡可能用可替換或可高壓處理的加樣器,由于加樣器最容易受產物氣溶膠或標本DNA的污染,最好使用可替換或高壓處理的加樣器。如沒有這種特殊的加樣器,至少PCR操作過程中加樣器應該專用,不能交叉使用,尤其是PCR產物分析所用加樣器不能拿到其它兩個區。
(8)重復實驗,驗證結果,慎下結論。