凝膠色譜法又叫凝膠色譜技術，又稱分子排阻色譜法，其分離物質的原理為分子篩原理,且多用于分離有機大分子化合物,如蛋白質、多肽、多糖等。

根據分離的對象是水溶性的化合物還是有機溶劑可溶物，又可分為凝膠過濾色譜（GFC）和凝膠滲透色譜（GPC）。凝膠過濾色譜一般用于分離水溶性的大分子，如多糖類化合物。凝膠的代表是葡萄糖系列，洗脫溶劑主要是水。凝膠滲透色譜法主要用于有機溶劑中可溶的高聚物 (聚苯乙烯、聚氯已烯、聚乙烯、聚甲基丙烯酸甲酯等) 相對分子質量分布分析及分離，常用的凝膠為交聯聚苯乙烯凝膠，洗脫溶劑為四氫呋喃等有機溶劑。

凝膠色譜與凝膠層析基本上是一致的只是固定相存在差異。凝膠層析又稱分子篩過濾、排阻層析，操作條件比較溫和，可在相當廣的溫度范圍下進行，并且對分離成分理化性質的保持有獨到之處。兩者的共同點是都不需要有機溶劑。凝膠色譜色譜一般用在HPLC等分析場合。而凝膠層析一般用在制備的時候。

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